自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方
灵枢经
卷一医说五脏六腑脉病虚实肝脏脉病虚实心脏脉病虚实脾脏脉病虚实肺脏脉病虚实肾脏脉病虚实胆经虚实病候小肠虚实病候胃经虚实病候大肠虚实病候膀胱经虚实病候三焦虚实病候五脏补泻主治例十二经络奇经八脉诊脉七表八里
素灵微蕴序素灵微蕴卷一胎化解脏象解经脉解营卫解脏候解素灵微蕴卷二五色解五声解问法解诊法解医方解素灵微蕴卷三齁喘解吐血解惊悸解悲恐解飧泄解肠澼解脾胃解火逆解素灵微蕴卷四消渴解气鼓解噎膈解反胃解中风解带下
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
叙卷上诊法常以平旦望色常宜定静明堂周身部位明堂六部提纲面貌分应脏腑五官分应五脏五色分应五脏相气十法提纲望法阴阳总纲五色相应提纲五色主病提纲部色主病提纲四时望法相参四时气色主病昼夜阴晴相参五方望法相参气