正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
卷上第一章·外疡总论第一节·论阴证阳证第二节·论肿第三节·论痛第四节·论痒第五节·论酸楚不痛第六节·论顽木不痛第七节·论肿疡辨脓之法第八节·论脓之色泽形质第九节·论溃疡之水第十节·论溃疡之血第十一节·
伤寒直格方
素问玄机原病式
祝由十三科
灵枢经
原序上卷胎前总论恶阻胎动不安胎动腹痛胎漏下血漏胎跌扑动胎小便带血子淋子肿子满子悬子烦子嗽子疟子痫子喑外感风寒霍乱吐泻下痢热症因怒满闷小腹重坠作痛小腹虚胀闭滞胎冷腹痛欲泻胎惊心悸气促胀痛不安头眩目晕痰壅
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
序卷上本经上品人参甘草黄白术苍术（附）薯蓣石斛酸枣仁大枣芡实莲实莲花（附）莲蕊须（附）莲房（附）莲薏（附）荷叶（附）荷鼻（附）薏苡仁大麻仁巨胜子赤箭干地黄麦门冬天门冬葳蕤牛膝杜仲枸杞枸杞苗（附）地骨皮
序退思集类方歌注麻黄汤类麻黄汤麻黄加术汤麻黄杏仁甘草石膏汤麻黄杏仁薏苡甘草汤越脾汤越脾加术汤越脾加半夏汤大青龙汤小青龙汤小青龙加石膏汤甘草麻黄汤麻黄附子汤麻黄附子细辛汤麻黄连翘赤小豆汤麻黄升麻汤浓朴麻