绪言卷一摄生第一阴阳第二脏象上第三脏象下第三卷二脉色上第四脉色下第四经络上第五卷三经络下第五标本第六气味第七论治第八卷四疾病第九病机邪气阴阳卷四疾病第十经脏虚实时令卷五疾病第十一五气情志风厥伤寒卷五疾
七十二症辨治方法
简介细目序凡例卷一卷二卷三卷四跋
简介赵叙正文
序凡例九针式卷一难经一、补泻二、补泻相反三、针刺浅深四、先后浅深五、井荥俞经合主病六、四时井荥俞经合刺七、脏腑荥俞合皆以井为始八、脏腑井荥为五六九、阴阳井荥木金相生不同十、出井入合十一、欲刺井当刺荥十
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
重修本草之记重修证类本草序政和新修经史证类备用本草序证类本草所出经史方书卷第一嘉补注总叙本草图经序开宝复位序唐本序梁·陶隐居序上合药分剂料理法则补注所引书传林枢密重广本草图经序雷公炮炙论序新添本草衍义
秘藏膏丹丸散方剂
叙卷上卷上一卷上二卷上三卷上四卷上五卷上六卷下卷下一卷下二卷下三卷下四卷下五
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又