自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
提要序一序二叙自叙卷上田展初内治效颜凤尧内治效笪豫川治效筿村侄治效兼及诸小溲不通治效牙痛治效龚玉屏治效并后不治之验龚玉屏子椿官治效并后不治之验蔡姓时医治效包式斋治效厉登铭疯症治效陈外甥疯症治效吴预生疯
提要上部中部下部十不治症一治通身药末方验愈
朱序张序前跋卷一守正辟邪论面部定位图解五轮八廓大略五轮解八廓解轮廓运气总论六气总论风寒暑湿燥火七情总论喜怒忧思悲恐惊卷二瞳神论心经主病肺经主病肝经主病脾经主病肾经主病三焦主病小肠主病胆经主病胃经主病大
眼科奇书
痎疟论疏
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（