绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
序正文卷（一）独参汤参附汤生脉饮保元汤四君子汤香砂六君子汤当归补血汤佛手散四物汤圣愈汤地骨皮饮犀角地黄汤四生丸当归六黄汤黄建中汤双和饮人参养荣汤归脾汤妙香散天王补心丹酸枣仁汤朱砂安神丸卷（二）补中益气
自叙跋卷首六经解六气解营卫解风寒解传经解里气解卷一·太阳经风寒原委提纲 (卷一)太阳中风桂枝汤证太阳伤寒麻黄汤证太阳风寒两感桂麻各半汤证太阳风寒大青龙汤证衄血太阳伤寒小青龙汤证太阳风寒白虎汤证太阳伤寒
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
兰台轨范
类证普济本事方
阴阳五行阴阳阳常有余，阴常不足阳化气，阴成形阳气阳强不能密，阴气乃绝阳杀阴藏阳生阴长阳生于阴阳胜则阴病阳损及阴阳中之阳阳中之阴阴不抱阳阴平阳秘阴气阴生于阳阴胜则阳病阴损及阳阴阳阴阳乖戾阴阳互根阴阳离决
医闾先生集序卷首医闾先生集卷一医闾先生集卷三医闾先生集卷四医闾先生集卷五医闾先生集卷六医闾先生集卷之 【 之：衍文】 七医闾先生集卷八医闾先生集卷九书医闾先生集后
卷一月经前期论（一）月经后期论（二）月经或前或后（三）卷二脉法辨孕男女脉法歌调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘胎衣不下产后寒热产后血晕产后腹痛阴户脱卷三调经种子崩漏论赤白带
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙