卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证并治第二卷二百合狐惑阴阳毒病脉证并治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证并治第七卷三奔豚气病脉证并治第八胸痹心痛短
咽喉脉证通论
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
序浮（阳）沉（阴）迟（阴）数（阳）滑（阳中阴）涩（阴）虚（阴）实（阳）长（阳）短（阴）洪（阳）微（阴）紧（阳）缓（阴）芤（阳中阴）弦（阳中阴）革（阴）牢（阴中阳）濡（阴）弱（阴）散（阴）细（阴）伏（阴
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
尚论篇
序叙卷之一·元集总论辨眼症虚实论辨眼疼有虚实论辨药宜忌论辨热症有虚实气不同论辨五轮病源用药论辨五轮生克论辨心火克肺金白珠生赤丝论辨肺金克肝木黑睛生翳膜论辨眼内生云翳用凉药难退论辨眼珠生翳膜滋肾更甚论辨
袁序陆序陆序自序卷一原因原贼邪原风湿原荣卫原易伤寒温热延医论论河间说伤寒之误原瘴原痧原胎成注《伤寒论》论五志论阴阳交并论虫论温疫总论疟论尸疰疳蒸四大症论虚劳论传尸劳论肺萎论正水风水诊法论女劳疸黑疸同治
正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天