序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
序一序二自叙卷首 十二经络图象手太阴肺经图手阳明大肠经图足阳明胃经图足太阴脾经图手少阴心经图手太阳小肠经图足太阳膀胱经图足少阴肾经图心包络经图三焦经图足少阳胆经图足厥阴肝经图卷上肺经第一大肠经第二胃经
外科发挥
第1部分第2部分第3部分
自序卷上 辨证瘴疟形状人身肖天地瘴疟类天时受病之源瘴疟伤寒辨瘴疟内伤辨诸疟瘴疟辨伤寒瘴疟分南北辨瘴疟五脏俱病冷瘴热瘴瘴不治症脉日期妇人小儿发瘴时调理却病法瘴病中将息法瘴病后将息法灸法瘴后变症痢肿胀痰治
自叙凡例卷一中风类中伤风中寒伤寒劳复、食复、女劳复、阴阳易卷二温热病瘟疫大头瘟暑湿消渴火霍乱泄泻伤食不食卷三疟痢疟痢呃逆厥痉疝气冲眩晕卷四虚损痨瘵恶寒发热血证衄血下血溺血汗卷五七情喜怒忧思悲恐惊郁诈病
脏腑虚实标本用药式
自序卷一医范医鉴慎疾保生慎药求医诊法脉用药卷二古人今人古书今书卷三形体中风伤寒阴证阳证暑暑风霍乱转筋（俗称吊脚痧）热热入心胞疫痧疟三阴疟痢泻疝咳嗽噎吐头痛胁痛腹痛肝病七情不寐卷四吐血诸血汗疸肿消伤食邪
药性歌括四百味
导言五菜药解韭菜葱薤（蒜苗）葵藿五谷药解粳米小麦大豆黍米(又称糯小米、黄米)芝麻(又名胡麻、脂麻)五果药解杏李桃栗枣五畜药解猪肉牛肉羊肉鸡肉狗肉