论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方
前序卷上经候不调经漏不止经闭不行带下血分水分小便出血热入血室师尼寡妇寒热历节痛风（即白虎历节风）流注瘰乳痈乳岩血风疮疮阴疮（交接出血、阴挺、阴痒、阴虫附）附方并注卷下保胎小产保产子死腹中胎衣不出交骨不
第1部分第2部分第3部分第4部分
咽喉脉证通论
颅顖经
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
医垒元戎
祝由十三科
金匮要略金匮要略方论序卷上 藏府经络先后病脉证第一卷上 痉湿喝病脉证第二卷上 百合狐惑阴阳毒病证治第三卷上 疟病脉证并治第四卷上 中风历节病脉证并治第五卷上 血痹虚劳病脉证并治第六卷上 肺痿肺痈咳嗽上
自序卷上石膏滑石芒硝甘草黄人参桔梗术白头翁卷中黄连黄芩柴胡贝母细辛当归芎芍药牡丹皮茵陈蒿艾麻黄地黄葶苈大黄大戟甘遂附子半夏芫花五味子栝蒌实葛根防己卷下香豉泽泻薏苡仁薤白干姜杏仁大枣橘皮吴茱萸瓜蒂桂枝浓