绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
序伤寒论序伤寒卒病论集卷第一辨脉法第一平脉法第二卷第二伤寒例第三辨痉湿暍脉证第四辨太阳病脉证并治法上第五桂枝汤方桂枝二越婢一汤方甘草干姜汤方芍药甘草汤方调胃承气汤方四逆汤方卷第三辨太阳病脉证并治中第六
序正文卷（一）独参汤参附汤生脉饮保元汤四君子汤香砂六君子汤当归补血汤佛手散四物汤圣愈汤地骨皮饮犀角地黄汤四生丸当归六黄汤黄建中汤双和饮人参养荣汤归脾汤妙香散天王补心丹酸枣仁汤朱砂安神丸卷（二）补中益气
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
原序本草从新凡例药性总义卷一草部山草类人参珠儿参党参土人参西洋人参北沙参空沙参甘草黄精萎蕤黄野白术种白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿巴戟天琐阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
黄帝内经素问序重广补注黄帝内经素问序自序新刻叙卷一 养生上古天真论一四气调神论二金匮真言论三生气通天论四阴阳应象论五卷二 脏象十二脏相使论六五脏别论七五脏生成论八脏气法时论九宣明五气十卷二 脉法经脉别
类证普济本事方
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
卷一目睛原始歌五轮所属部位歌五轮主五脏病歌八廓部位歌八廓所属歌八廓主六腑命门包络病歌内因为病歌外因为病歌不内外因为病歌内障总名歌内障初患久变五风歌五风初患有余歌五风初患不足歌黄风有余歌黄风不足歌绿风有