自叙卷上脾胃伤风中寒暑热暑厥中伏暑注夏湿燥火症风湿风温湿温瘾疹痛风劳倦痰火咳嗽喘青筋气怒中恶伤食卷下伤酒黄胆积聚瘕僻痞块癫狂痫症三消霍乱疟疾痢疾泄泻疝气香港脚痿症
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张序自序卷上经义论证阴虚论治阳虚论治咳嗽失血骨蒸遗精女人月闭诸虚见症论虚损劳瘵论虚损传变论五劳七伤六极辨虚火论脉论爪论嚏虚损危候辨似损非损卷下六味地黄丸八味丸（崔氏）大补元煎（新方）左归饮（新方）右归
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑
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刘叙自叙凡例卷一多读书论脉位法天地五行论提纲论因形气以定诊论运气论太素脉论审象论脉有亢制论冲阳太二脉论脉有不可言传论脉无根有两说论调息已定然后诊脉论问情论卷二卷三浮脉（阳）沉脉（阴）迟脉（阴）数脉（阳
序一序二凡例卷之一伤寒伤寒论两感论附：嗣真少阴症似太阳太阳脉似少阴不同论太阳论阳明少阳论三阴论三焦论阴证论阴虚论内伤论表症论里症论热症论舌论附金镜录辨舌黑治法结胸论发狂谵语蓄血发发疹（附）发黄吐蛔厥症
脉诀指掌病式图说
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卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固