卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
重刊宋本洪氏集验方序重刊宋本洪氏集验方后叙卷第一治痢肉豆蔻散祛疟散大交泰丹混元胎丹还少丹琼玉膏一粒金丹神妙六逸丸铁瓮申先生交感丹降气汤牙药卷第二（痈疽）化毒排脓内补散神授痈疽灵方治乳痈发背，诸般疮毒灵
自叙凡例白喉证论辩证法辨脉法用药法白喉热证尚轻治法白喉热证渐重治法白喉寒证尚轻治法白喉寒证渐重治法白喉虚热证治法白喉虚寒证治法白喉寒热错杂证治法续方白喉误治坏证治法白喉愈后补虚治法妇人白喉证小儿白喉证
提要看症口诀四季口诀大寒小寒七香跌打丸跌打总方回生丹跌打吊瘀煎水洗方
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记
祝由十三科