序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
序凡例上品丹砂云母石钟乳矾石朴硝滑石禹余粮紫石英五石脂扁青菖蒲菊花甘草干地黄术菟丝子牛膝柴胡麦门冬车前子木香薏苡仁泽泻龙胆细辛石斛蓍实黄连黄肉苁蓉防风续断决明子丹参五味子蛇床子沙参菌桂松脂槐实柏实茯苓
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
正文浮沉迟数滑涩人迎气口阳维阴维阳跷阴跷督任冲带附录运功规法南北规中引南旋式北旋式
一画二画三画四画五画六画七画八画九画十画十一画十二画十三画十四画十五画以上
自序卷上 辨证瘴疟形状人身肖天地瘴疟类天时受病之源瘴疟伤寒辨瘴疟内伤辨诸疟瘴疟辨伤寒瘴疟分南北辨瘴疟五脏俱病冷瘴热瘴瘴不治症脉日期妇人小儿发瘴时调理却病法瘴病中将息法瘴病后将息法灸法瘴后变症痢肿胀痰治
卷一经候门经闭痛经潮热、蒸热、寒热鼻衄带下崩漏阴肿门卷二种子门卷三胎前门恶阻胎动不安漏胎心腹胀满
第1部分第2部分第3部分第4部分
序一序二序三凡例寒性药品苦参升麻葛根柴胡前胡甘草黄连黄芩黄柏知母干地黄熟地黄芍药（白赤）大黄青皮枳壳枳实猪苓泽泻木通栝蒌桑白皮葶苈子滑石薄荷防风天门冬麦门冬牡丹皮红蓝花苏木栀子桃仁连翘地榆石膏马兜铃枇
总论时气（天时一）阴阳（天时二）地利（地利一）基址（地利二）十机（人事一）附∶小产论蓄外家（人事二）药食（论方）饮食（戒饮）男病（疾病一）女病（疾病二）附：衍庆编调经至言辨古续篇大意干道（蓄德一）坤道