序卷一十二官六脏六腑纳甲诗内景说心说肝说脾说肺说肾说胃说胆说大肠小肠说三焦说手心主说(即心包络)膀胱说命门说附录高士宗部位说经络易知十二经脉起止图十六络穴图经络说十二经诗十六络诗十二经气血流注诗（旧本
修订说明写在卷首诊脉传心诀诸脉主病诊脉总要诊脉六法三部总看歌发言须当理引经药用药传心赋治病主药诀四君汤加减歌四物汤加减歌二陈汤加减歌小柴胡汤加减歌平胃散加减歌病因赋百病皆生于六气诸症莫逃乎四因伤寒症传
卷上·正编风病诸候上风偏枯候风失音不语候风口候风四肢拘挛不得屈伸候风身体两足不随候风鳅手足不随候偏风候风不仁候风湿痹候风湿候风鳅候风惊候风病诸候下风冷候头面风候风头眩候风癫候风邪候鬼邪候风瘙身体隐轸候
书《玉机微义》后序兰室集·医家十要兰室誓戒戒行吟调鼎吟风火暑湿燥寒发热腹痛头痛腰痛胁痛心痛牙疼眼目泻痢疟（又名）咳嗽吐衄血溺血下血诸气漏淋小水不禁（详淋）喉痹诸疮漏疮疥风癣痔疮疮疝香港脚转筋痿内伤痰饮
提要上部中部下部十不治症一治通身药末方验愈
卷一卷一伤寒传经从阳化热从阴化寒原委太阳风邪伤卫脉证太阳寒邪伤营脉证风寒营卫同病脉证误服三汤致变救逆三阳受病传经欲愈脉证阳明表病脉证阳明热病脉证阳明腑病脉证阳明慎汗慎清慎下少阳脉证少阳病用柴胡汤加减法
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
金疮赋按脉论行拳法分轻重论打人论总论秘授跌打损伤要诀金枪论接骨诸方金枪不治症又接骨议论方
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
一、发散解表紫苏粥葱白粥干葛粥生姜粥葱豉粥神仙粥发汗鼓粥姜苏饮姜糖葱白饮银花簿荷饮菜根红糖饮罗汉果饮葱豉汤香薷饮桑叶菊花饮蜜糖银花露杭菊糖茶二、化痰止咳江米粥牛蒡粥阿胶粥杏仁蒸肉白果鸡丁玉参焖鸭虫草鹌