一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致
济生方
医案精华
龙木集序卷之一龙木总论一 审的歌发挥二 眼叙论三 三因证治四 五轮歌五 内障眼法根源歌六 针内障眼法歌七 针内障眼叙法歌八 小儿歌九 合药矜式十 煎药诀十一 服药须知十二 点眼药诀卷之一七十二证方论一
自序集之一·初生门证治通论钱氏论五脏所主五脏病五脏相胜洁古论五脏五邪相乘补泻大法五脏补泻法察色听声脉法死证襁褓乳哺乳儿法乳令儿病证哺儿法断乳法杂将护法集之一·初生门初生拭口法浴儿法断脐法灸脐法裹脐法服
洄溪医案
贾序范序查序鲁序全书纪略卷之一入集 传忠录（上）明理（一）阴阳篇（二）六变辩（三）表证篇（四）里证篇（五）虚实篇（六）寒热篇（七）寒热真假篇（八）十问篇（九）论治篇（十）气味篇（十一）卷之二入集 传忠
序一序二卷上疗发背痈疽灸法用药第一痈疽备论第二痈疽灸法论第三骑竹马灸法第四论隔蒜灸得效第五背疽肿漫寻头灸法第六蒜饼施用分其轻重第七灸法要论第八痈疽灼艾痛痒论第九脑疽灸法第十痈疽既灸服药护脏腑论第十一马
吴序恽序盛序程序自序凡例用药法程草部山草类人参丹参沙参元参苦参苍术白术甘草黄远志玉竹知母贝母秦艽白藓皮升麻柴胡前胡独活细辛防风羌活桔梗黄连胡黄连黄芩天麻龙胆草茅根延胡索地榆巴戟天肉苁蓉淫羊藿贯众金毛脊