自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
序卷一风温温疫卷二暑温伏暑温毒湿温冬温卷三中风少阳螈肝风肝厥胁痛肝痈癫狂虚劳吐血便血肿胀单腹胀滞下（俗名痢疾，又曰积。红色属热，属血，白色属寒、属气。）积聚淋浊泄泻卷四痘症噎呕吐反胃哕失音水气寒湿痹风
叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方
上品卷第一玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石芒硝滑石紫石英白石英青石脂赤石脂黄石脂白石脂黑石脂太一禹余粮禹余粮青玉白玉髓璧玉合玉石陵石碧石青五羽石石流青石流赤六芝赤箭龙眼猪苓茯苓茯神
百家针灸歌赋
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序卷一金石部金银箔黄丹胡粉铜青铁浆铁锈水银轻粉银朱密陀僧丹砂钟乳矾石禹余粮硝石滑石石膏青盐食盐雄黄紫石英赤石脂寒水石花蕊石阳起石蓬砂胆矾青礞石无名异玉屑自然铜石燕磁石硫黄果部陈皮青皮枳壳枳实杏仁桃仁大
序卷上医之可法或问手足太阳、手足阳明、手足少阳、俱会于首、然六阳会于首者、亦有阴乎经脉终始日用人肖天地问脾寄于坤如何．是损至第三．若从脾为．第二从肾为第四请言脾数明经络之数有几问三焦有几问脏腑有几伤寒
原序凡例前编/分野一、〔巅顶〕二、〔头〕三、〔囟〕四、〔额〕五、〔头角〕六、〔枕骨〕七、〔颁〕八、〔HT〕九、〔面〕十、〔眉〕十一、〔目〕十二、〔目睛〕十三、〔瞳子〕十四、〔目眶〕十五、〔目内〕十六、
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