卷一脉之名义气口独以为五脏主脉辨至数日夜五十营诊贵平旦寸关尺之义三焦分发三部重轻审察阴阳辨别内经分发脏腑定位六气分合六部时日诊候之图政运有不应之脉人迎气口脉分四时六气脉分四方脉分五脏五脏平脉五脏病脉五
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
卷一月经前期论（一）月经后期论（二）月经或前或后（三）卷二脉法辨孕男女脉法歌调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘胎衣不下产后寒热产后血晕产后腹痛阴户脱卷三调经种子崩漏论赤白带
石药尔雅
序卷上总论指南赋入门察色五视法面上诸穴歌小儿无患歌调护歌入门候歌入门试法四十九脉图解详解脉纹辨色歌五指冷热歌审候歌脉法歌闻小儿声音辨小儿五音阳掌十八穴疗病诀阴掌九穴疗病诀附臂上五穴疗病诀足部十三穴疗病
难经经释
叙卷上卷上一卷上二卷上三卷上四卷上五卷上六卷下卷下一卷下二卷下三卷下四卷下五
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致
序卷上本经上品人参甘草黄白术苍术（附）薯蓣石斛酸枣仁大枣芡实莲实莲花（附）莲蕊须（附）莲房（附）莲薏（附）荷叶（附）荷鼻（附）薏苡仁大麻仁巨胜子赤箭干地黄麦门冬天门冬葳蕤牛膝杜仲枸杞枸杞苗（附）地骨皮