原序自序卷一脉论辨五脏六腑部位脉法辨人迎三部趺阳九候五脏六腑脉法诊诸病证脉法辨脉形及变化所主病证法卷二寒证热证风食风湿疟疾痹证劳伤气病血证卷三诸积诸痛眩晕厥证痰饮消证疸病卷四咳嗽喘证呕吐小便妇人科
人体解剖学歌诀内容运动系统运动系统歌诀全身骨歌诀各部椎骨特点歌诀胸骨歌诀颅骨歌诀鼻旁窦歌诀脊柱的韧带歌诀脊柱形态歌诀胸廓歌诀肩关节歌诀肘关节歌诀手腕骨歌诀膝关节歌诀跗骨歌诀颅底内面歌诀新生儿颅骨歌诀膈
序叙卷之一·元集总论辨眼症虚实论辨眼疼有虚实论辨药宜忌论辨热症有虚实气不同论辨五轮病源用药论辨五轮生克论辨心火克肺金白珠生赤丝论辨肺金克肝木黑睛生翳膜论辨眼内生云翳用凉药难退论辨眼珠生翳膜滋肾更甚论辨
自序卷一脉法察舌要言四家异同重药轻投辩同病各发中风中络中经中腑中脏口眼斜半身不遂中风僵卧中风僵卧中风僵卧中风僵卧中寒真心痛厥心痛直中少阴直中厥阴直中厥阴暑热湿刚痉柔痉伤暑中暑伤热伤湿呕吐泄泻霍乱转筋发
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天
序一序二序三序四卷一（礼集）正医法反医法顺医法逆医法内治法外治法完治法碎治法大治法小治法偏治法全治法生治法死治法卷二（乐集）上治法中治法下治法先治法后治法急治法缓治法本治法末治法不内外治法阴治法阳治法
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
序一序二一卷 摄生类一、上古之人春秋百岁今时之人半百而衰二、上古圣人之教下三、古有真人至人圣人贤人四、四气调神五、天气清静藏德不止圣人从之故无奇病六、四时阴阳从之则生逆之则死七、不治已病治未病二卷