卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
序上籍食治养老益气方第一食治老人眼目方第二食治老人耳聋耳鸣诸方第三食治老人五劳七伤诸方第四食治老人虚损羸瘦诸方第五食治老人脾胃气弱方第六食治老人泻痢诸方第七食治老人烦渴热诸方第八食治老人水气诸方第九食
养性延命录教诫篇第一食诫篇第二杂诫忌禳害祈善篇第三服气疗病篇第四导引按摩篇第五御女损益篇第六西山群仙会真记序识道识法识人识时识物养生养形养气养心养寿补内补气补精补益补损真水火真龙虎真丹药真铅汞真阴阳炼
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
第1部分第2部分
简介序卷一 内科卷二 妇人科卷三 小儿科卷四 外科卷五 通治
序饮食色欲箴序阳有余阴不足论治病必求其本论涩脉论养老论慈幼论夏月伏阴在内论豆疮陈氏方论痛风论疟论病邪虽实胃气伤者勿使攻击论治病先观形色然后察脉问证论大病不守禁忌论虚病痰病有似邪祟论面鼻得冷则黑论胎自堕
石药尔雅
第1部分第2部分第3部分
序卷上医之可法或问手足太阳、手足阳明、手足少阳、俱会于首、然六阳会于首者、亦有阴乎经脉终始日用人肖天地问脾寄于坤如何．是损至第三．若从脾为．第二从肾为第四请言脾数明经络之数有几问三焦有几问脏腑有几伤寒