正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
序一序二备急灸法屈指量法例诸发等证肠痈疔疮附骨疽皮肤中毒风卒暴心痛转胞小便不通霍乱霍乱转筋风牙疼精魅鬼神所淫夜魇不寤卒忤死法溺水自缢急喉痹鼻衄妇人难生小肠气一切蛇伤治犬咬治狂犬所咬点灸法下火法用火法候
医脉摘要
卷一目睛原始歌五轮所属部位歌五轮主五脏病歌八廓部位歌八廓所属歌八廓主六腑命门包络病歌内因为病歌外因为病歌不内外因为病歌内障总名歌内障初患久变五风歌五风初患有余歌五风初患不足歌黄风有余歌黄风不足歌绿风有
风劳臌膈四大证治
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
徐序刘序朱子跋郭长阳医书自序卷一伤寒名例十问叙论五问治法大要九问伤寒脉法及刺法六问张仲景华元化五问卷二仲景辨脉法三十八条卷三仲景平脉法四十五条卷四六经统论二十二问太阳经证治上九十五条卷五太阳经证治下九
医家小传伤风伤风转少阳证伤风转结胸证伤风汗多阳虚证伤寒夏令伤寒证（一）夏令伤寒证（二）冬令伤寒证冬令伤寒液少证湿温湿温化燥证产后湿温化燥证湿温肠出血证湿温夹食重证热病热病夹食重证热病神昏发厥证阳明热病
洄溪医案
自序凡例卷上寒总论肾虚人易犯伤寒论不服药为中医论两感论时行疫症伤寒十六症类伤寒六症内伤外感辨治伤寒宜早视伤寒宜详辨成氏再传之讹六经七日病愈论仲景三百九十七法一百一十三方论陶氏辨差认十六条察色法察目法察