序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
金匮要略金匮要略方论序卷上 藏府经络先后病脉证第一卷上 痉湿喝病脉证第二卷上 百合狐惑阴阳毒病证治第三卷上 疟病脉证并治第四卷上 中风历节病脉证并治第五卷上 血痹虚劳病脉证并治第六卷上 肺痿肺痈咳嗽上
鬼门十三针
少林寺秘传十二时辰十二穴道二十四方
叙正文跋
序饮食色欲箴序阳有余阴不足论治病必求其本论涩脉论养老论慈幼论夏月伏阴在内论豆疮陈氏方论痛风论疟论病邪虽实胃气伤者勿使攻击论治病先观形色然后察脉问证论大病不守禁忌论虚病痰病有似邪祟论面鼻得冷则黑论胎自堕
卷第一玉石部玉屑车渠金线矾波斯白矾金屑银屑石流黄绿盐紫骐竭珊瑚石蟹胡桐泪卷第二草部人参木香草犀根薇白兔藿无风独摇草人肝藤石海根越王余通草兜纳香风延母大瓠藤水海藻昆布阿魏荜茇酱延胡索红豆蔻肉豆蔻零陵香补
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
序一序二序三序四凡例十六则劝医六则七方论十剂论辟陶隐居十剂内增入寒热二剂论辟缪仲醇十剂内增升降二剂论卷之一（宫集）人参黄芪甘草白术苍术熟地生地当归牛膝远志石菖蒲卷之二（商集）天门冬麦门冬五味子菟丝子甘
序重刻序卷一升降部围药部内消部内护部卷二化毒部点头部拔毒部去腐部止痛部生肌收口部去管部膏药部卷三疔疮部喉症部诸疮部卷四疮部癣疮部痔疮部口牙部鼻耳部脚部补遗